Canonical Allele Identifier: CA1304946192
Gene: SCN9A HGNC NCBI
SCN1A-AS1 HGNC NCBI

Genomic Alleles

HGVS Genome Assembly
NC_000002.12:g.166233096_166233118delinsCATATATGCATACTATATATAGT , CM000664.2:g.166233096_166233118delinsCATATATGCATACTATATATAGT GRCh38
NC_000002.11:g.167089606_167089628delinsCATATATGCATACTATATATAGT , CM000664.1:g.167089606_167089628delinsCATATATGCATACTATATATAGT GRCh37
NC_000002.10:g.166797852_166797874delinsCATATATGCATACTATATATAGT NCBI36
NG_012798.1:g.147870_147892delinsACTATATATAGTATGCATATATG , LRG_369:g.147870_147892delinsACTATATATAGTATGCATATATG

Transcript Alleles

HGVS Amino-acid Change
ENST00000303354.11:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000304748.7:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
ENST00000409435.6:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000386330.2:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
ENST00000642356.2:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) MANE Select ENSP00000495601.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
ENST00000644316.1:c.3769-4146_3769-4124delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000493939.1:n.3769-4146_3769-4124delinsACTATATATAGTATGC...
ENST00000645907.1:c.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000495983.1:n.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
ENST00000303354.10:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000304748.7:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
ENST00000409435.5:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000386330.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
ENST00000409672.5:c.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) ENSP00000386306.1:n.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCAT...
NM_002977.3:c.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG , LRG_369t1:c.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) NP_002968.1:n.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG
NR_110260.1:n.612-15099_612-15077delinsCATATATGCATACTATATATAGT (SCN1A-AS1)
XM_005246757.1:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_005246814.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511616.1:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509918.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511617.1:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509919.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511618.1:c.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509920.1:n.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511619.1:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509921.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
NM_001365536.1:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) MANE Select NP_001352465.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511616.3:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509918.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511617.2:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509919.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511618.2:c.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509920.1:n.3891+222_3891+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_011511619.2:c.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_011509921.1:n.3924+222_3924+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_017004668.1:c.3537+222_3537+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_016860157.1:n.3537+222_3537+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...
XM_017004669.1:c.3180+222_3180+244delinsACTATATATAGTATGCATATATG (SCN9A) XP_016860158.1:n.3180+222_3180+244delinsACTATATATAGTATGCATATA...