Canonical Allele Identifier: CA019921
Gene: MSH2 HGNC NCBI

Linked Data

dbSNP Id: rs587779132

Genomic Alleles

HGVS Genome Assembly
NC_000002.12:g.47476417_47476443delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA , CM000664.2:g.47476417_47476443delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA GRCh38
NC_000002.11:g.47703556_47703582delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA , CM000664.1:g.47703556_47703582delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA GRCh37
NC_000002.10:g.47557060_47557086delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA NCBI36
NG_007110.2:g.78294_78320delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA , LRG_218:g.78294_78320delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA

Transcript Alleles

HGVS Amino-acid change
ENST00000644900.2:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000495641.2:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000233146.7:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA MANE Select ENSP00000233146.2:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000543555.6:c.1858_1884delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000442697.1:p.Val620_Phe628delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000644092.1:c.*356_*382delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000496351.1:n.*356_*382delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
ENST00000645339.1:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000496441.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000645506.1:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000495455.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000646415.1:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000495543.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000233146.6:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000233146.2:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000406134.5:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000384199.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000543555.5:c.1858_1884delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000442697.1:p.Val620_Phe628delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
ENST00000610696.4:c.*452_*478delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000483159.1:n.*452_*478delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
ENST00000613514.4:c.*596_*622delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000484137.1:n.*596_*622delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
ENST00000617333.3:c.*822_*848delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000482468.1:n.*822_*848delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
ENST00000617938.4:c.*1028_*1054delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000481158.1:n.*1028_*1054delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA...
ENST00000621359.2:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA ENSP00000481416.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnI...
NM_000251.2:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA , LRG_218t1:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA NP_000242.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle
NM_001258281.1:c.1858_1884delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA NP_001245210.1:p.Val620_Phe628delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle
XM_005264332.2:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA XP_005264389.2:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle
XM_011532867.1:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA XP_011531169.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle
XR_939685.1:n.2128_2154delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
XM_005264332.4:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA XP_005264389.2:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle
XM_011532867.2:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA XP_011531169.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle
XR_001738747.2:n.2118_2144delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
XR_939685.2:n.2118_2144delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA
NM_000251.3:c.2056_2082delinsTATATGTTGTGCCATGTGAATATA MANE Select NP_000242.1:p.Val686_Phe694delinsTyrMetLeuCysHisValAsnIle