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Although replication attempts were unsuccessful, there is a high correlation with protein alleles. And with haplotype HGVS queries.
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| Chr | Mutation (hg38) | CAid | Gene | Transcript | Linkouts |
|---|---|---|---|---|---|
| 6 | g.29943701_29943702del | CA1087342718 | HLA-A | c.619+158_619+159del (n.619+158_619+159del) n.1053_1054del n.895+158_895+159del c.535+158_535+159del (n.535+158_535+159del) n.860+158_860+159del n.862+158_862+159del n.436+158_436+159del | dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943698_29943699delinsGA | CA1618518122 | HLA-A | c.619+155_619+156delinsGA (n.619+155_619+156delinsGA) n.1050_1051delinsGA n.895+155_895+156delinsGA c.535+155_535+156delinsGA (n.535+155_535+156delinsGA) n.860+155_860+156delinsGA n.862+155_862+156delinsGA n.436+155_436+156delinsGA | |
| 6 | g.29943699del | CA136024253 | HLA-A | c.619+156del (n.619+156del) n.1051del n.895+156del c.535+156del (n.535+156del) n.860+156del n.862+156del n.436+156del | dbSNP |
| 6 | g.29943699A>G | CA1087342726 | HLA-A | c.619+156A>G (n.619+156A>G) n.1051A>G n.895+156A>G c.535+156A>G (n.535+156A>G) n.860+156A>G n.862+156A>G n.436+156A>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943700G>A | CA2711413637 | HLA-A | c.619+157G>A (n.619+157G>A) n.1052G>A n.895+157G>A c.535+157G>A (n.535+157G>A) n.860+157G>A n.862+157G>A n.436+157G>A | dbSNP |
| 6 | g.29943700G>C | CA1087342727 | HLA-A | c.619+157G>C (n.619+157G>C) n.1052G>C n.895+157G>C c.535+157G>C (n.535+157G>C) n.860+157G>C n.862+157G>C n.436+157G>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943700G>T | CA1087342728 | HLA-A | c.619+157G>T (n.619+157G>T) n.1052G>T n.895+157G>T c.535+157G>T (n.535+157G>T) n.860+157G>T n.862+157G>T n.436+157G>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943701A>C | CA1087342729 | HLA-A | c.619+158A>C (n.619+158A>C) n.1053A>C n.895+158A>C c.535+158A>C (n.535+158A>C) n.860+158A>C n.862+158A>C n.436+158A>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943701A>G | CA1087342730 | HLA-A | c.619+158A>G (n.619+158A>G) n.1053A>G n.895+158A>G c.535+158A>G (n.535+158A>G) n.860+158A>G n.862+158A>G n.436+158A>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943703T>A | CA1087342735 | HLA-A | c.619+160T>A (n.619+160T>A) n.1055T>A n.895+160T>A c.535+160T>A (n.535+160T>A) n.860+160T>A n.862+160T>A n.436+160T>A | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943703T>C | CA1087342733 | HLA-A | c.619+160T>C (n.619+160T>C) n.1055T>C n.895+160T>C c.535+160T>C (n.535+160T>C) n.860+160T>C n.862+160T>C n.436+160T>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943703T>G | CA1087342732 | HLA-A | c.619+160T>G (n.619+160T>G) n.1055T>G n.895+160T>G c.535+160T>G (n.535+160T>G) n.860+160T>G n.862+160T>G n.436+160T>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943704G>A | CA1618518126 | HLA-A | c.619+161G>A (n.619+161G>A) n.1056G>A n.895+161G>A c.535+161G>A (n.535+161G>A) n.860+161G>A n.862+161G>A n.436+161G>A | dbSNP |
| 6 | g.29943704G= | CA1618518125 | HLA-A | c.619+161G= (n.619+161G=) n.1056G= n.895+161G= c.535+161G= (n.535+161G=) n.860+161G= n.862+161G= n.436+161G= | |
| 6 | g.29943704G>T | CA2594382457 | HLA-A | c.619+161G>T (n.619+161G>T) n.1056G>T n.895+161G>T c.535+161G>T (n.535+161G>T) n.860+161G>T n.862+161G>T n.436+161G>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943705A>C | CA1087342738 | HLA-A | c.619+162A>C (n.619+162A>C) n.1057A>C n.895+162A>C c.535+162A>C (n.535+162A>C) n.860+162A>C n.862+162A>C n.436+162A>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943705A>G | CA1087342744 | HLA-A | c.619+162A>G (n.619+162A>G) n.1057A>G n.895+162A>G c.535+162A>G (n.535+162A>G) n.860+162A>G n.862+162A>G n.436+162A>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943705A>T | CA1087342741 | HLA-A | c.619+162A>T (n.619+162A>T) n.1057A>T n.895+162A>T c.535+162A>T (n.535+162A>T) n.860+162A>T n.862+162A>T n.436+162A>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943706C>A | CA1087342750 | HLA-A | c.619+163C>A (n.619+163C>A) n.1058C>A n.895+163C>A c.535+163C>A (n.535+163C>A) n.860+163C>A n.862+163C>A n.436+163C>A | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943706C= | CA1618518128 | HLA-A | c.619+163C= (n.619+163C=) n.1058C= n.895+163C= c.535+163C= (n.535+163C=) n.860+163C= n.862+163C= n.436+163C= | |
| 6 | g.29943706C>T | CA136024254 | HLA-A | c.619+163C>T (n.619+163C>T) n.1058C>T n.895+163C>T c.535+163C>T (n.535+163C>T) n.860+163C>T n.862+163C>T n.436+163C>T | dbSNP |
| 6 | g.29943707T>A | CA1087342767 | HLA-A | c.619+164T>A (n.619+164T>A) n.1059T>A n.895+164T>A c.535+164T>A (n.535+164T>A) n.860+164T>A n.862+164T>A n.436+164T>A | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943707T>C | CA1087342771 | HLA-A | c.619+164T>C (n.619+164T>C) n.1059T>C n.895+164T>C c.535+164T>C (n.535+164T>C) n.860+164T>C n.862+164T>C n.436+164T>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943707T>G | CA1087342772 | HLA-A | c.619+164T>G (n.619+164T>G) n.1059T>G n.895+164T>G c.535+164T>G (n.535+164T>G) n.860+164T>G n.862+164T>G n.436+164T>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943708C>A | CA1087342775 | HLA-A | c.619+165C>A (n.619+165C>A) n.1060C>A n.895+165C>A c.535+165C>A (n.535+165C>A) n.860+165C>A n.862+165C>A n.436+165C>A | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943708C>G | CA1087342780 | HLA-A | c.619+165C>G (n.619+165C>G) n.1060C>G n.895+165C>G c.535+165C>G (n.535+165C>G) n.860+165C>G n.862+165C>G n.436+165C>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943708C>T | CA1087342781 | HLA-A | c.619+165C>T (n.619+165C>T) n.1060C>T n.895+165C>T c.535+165C>T (n.535+165C>T) n.860+165C>T n.862+165C>T n.436+165C>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943709T>C | CA1087342783 | HLA-A | c.619+166T>C (n.619+166T>C) n.1061T>C n.895+166T>C c.535+166T>C (n.535+166T>C) n.860+166T>C n.862+166T>C n.436+166T>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943709T>G | CA1087342784 | HLA-A | c.619+166T>G (n.619+166T>G) n.1061T>G n.895+166T>G c.535+166T>G (n.535+166T>G) n.860+166T>G n.862+166T>G n.436+166T>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943710G>A | CA2566730338 | HLA-A | c.619+167G>A (n.619+167G>A) n.1062G>A n.895+167G>A c.535+167G>A (n.535+167G>A) n.860+167G>A n.862+167G>A n.436+167G>A | |
| 6 | g.29943710G>C | CA1618518131 | HLA-A | c.619+167G>C (n.619+167G>C) n.1062G>C n.895+167G>C c.535+167G>C (n.535+167G>C) n.860+167G>C n.862+167G>C n.436+167G>C | dbSNP |
| 6 | g.29943710G= | CA1618518130 | HLA-A | c.619+167G= (n.619+167G=) n.1062G= n.895+167G= c.535+167G= (n.535+167G=) n.860+167G= n.862+167G= n.436+167G= | |
| 6 | g.29943710G>T | CA1087342785 | HLA-A | c.619+167G>T (n.619+167G>T) n.1062G>T n.895+167G>T c.535+167G>T (n.535+167G>T) n.860+167G>T n.862+167G>T n.436+167G>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943711A>G | CA1087342786 | HLA-A | c.619+168A>G (n.619+168A>G) n.1063A>G n.895+168A>G c.535+168A>G (n.535+168A>G) n.860+168A>G n.862+168A>G n.436+168A>G | dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943712G>C | CA1087342787 | HLA-A | c.619+169G>C (n.619+169G>C) n.1064G>C n.895+169G>C c.535+169G>C (n.535+169G>C) n.860+169G>C n.862+169G>C n.436+169G>C | dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943712G= | CA1618518133 | HLA-A | c.619+169G= (n.619+169G=) n.1064G= n.895+169G= c.535+169G= (n.535+169G=) n.860+169G= n.862+169G= n.436+169G= | |
| 6 | g.29943712G>T | CA1087342789 | HLA-A | c.619+169G>T (n.619+169G>T) n.1064G>T n.895+169G>T c.535+169G>T (n.535+169G>T) n.860+169G>T n.862+169G>T n.436+169G>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943713G>C | CA1087342793 | HLA-A | c.619+170G>C (n.619+170G>C) n.1065G>C n.895+170G>C c.535+170G>C (n.535+170G>C) n.860+170G>C n.862+170G>C n.436+170G>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943713G>T | CA1087342799 | HLA-A | c.619+170G>T (n.619+170G>T) n.1065G>T n.895+170G>T c.535+170G>T (n.535+170G>T) n.860+170G>T n.862+170G>T n.436+170G>T | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943714T>C | CA1087342804 | HLA-A | c.619+171T>C (n.619+171T>C) n.1066T>C n.895+171T>C c.535+171T>C (n.535+171T>C) n.860+171T>C n.862+171T>C n.436+171T>C | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943714T>G | CA136024255 | HLA-A | c.619+171T>G (n.619+171T>G) n.1066T>G n.895+171T>G c.535+171T>G (n.535+171T>G) n.860+171T>G n.862+171T>G n.436+171T>G | dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943714T= | CA1618518134 | HLA-A | c.619+171T= (n.619+171T=) n.1066T= n.895+171T= c.535+171T= (n.535+171T=) n.860+171T= n.862+171T= n.436+171T= | |
| 6 | g.29943715T>G | CA1087342808 | HLA-A | c.619+172T>G (n.619+172T>G) n.1067T>G n.895+172T>G c.535+172T>G (n.535+172T>G) n.860+172T>G n.862+172T>G n.436+172T>G | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943716C>A | CA2543874769 | HLA-A | c.619+173C>A (n.619+173C>A) n.1068C>A n.895+173C>A c.535+173C>A (n.535+173C>A) n.860+173C>A n.862+173C>A n.436+173C>A | |
| 6 | g.29943716C= | CA1618518136 | HLA-A | c.619+173C= (n.619+173C=) n.1068C= n.895+173C= c.535+173C= (n.535+173C=) n.860+173C= n.862+173C= n.436+173C= | |
| 6 | g.29943716C>T | CA1087342809 | HLA-A | c.619+173C>T (n.619+173C>T) n.1068C>T n.895+173C>T c.535+173C>T (n.535+173C>T) n.860+173C>T n.862+173C>T n.436+173C>T | dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943717C>A | CA1087342812 | HLA-A | c.619+174C>A (n.619+174C>A) n.1069C>A n.895+174C>A c.535+174C>A (n.535+174C>A) n.860+174C>A n.862+174C>A n.436+174C>A | gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943717C= | CA1618518138 | HLA-A | c.619+174C= (n.619+174C=) n.1069C= n.895+174C= c.535+174C= (n.535+174C=) n.860+174C= n.862+174C= n.436+174C= | |
| 6 | g.29943717C>T | CA823767900 | HLA-A | c.619+174C>T (n.619+174C>T) n.1069C>T n.895+174C>T c.535+174C>T (n.535+174C>T) n.860+174C>T n.862+174C>T n.436+174C>T | dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
| 6 | g.29943718G>A | CA136024257 | HLA-A | c.619+175G>A (n.619+175G>A) n.1070G>A n.895+175G>A c.535+175G>A (n.535+175G>A) n.860+175G>A n.862+175G>A n.436+175G>A | dbSNP gnomAD v2 gnomAD v3 gnomAD v4 |