Chr | Mutation (hg38) | CAid | Gene | Transcript | Linkouts |
---|---|---|---|---|---|
2 | g.47466704_47466714delinsACACAG | CA2695200709 | MSH2 | c.1557_1567delinsACACAG (p.Phe519LeufsTer8) c.1359_1369delinsACACAG (p.Phe453LeufsTer8) c.*97_*107delinsACACAG (n.*97_*107delinsACACAG) c.*323_*333delinsACACAG (n.*323_*333delinsACACAG) c.*529_*539delinsACACAG (n.*529_*539delinsACACAG) n.1629_1639delinsACACAG n.1619_1629delinsACACAG | ClinVar |
2 | g.47466709_47466713delinsATTAC | CA2495867286 | MSH2 | c.1562_1566delinsATTAC (p.Tyr521=) c.1364_1368delinsATTAC (p.Tyr455=) c.*102_*106delinsATTAC (n.*102_*106delinsATTAC) c.*328_*332delinsATTAC (n.*328_*332delinsATTAC) c.*534_*538delinsATTAC (n.*534_*538delinsATTAC) n.1634_1638delinsATTAC n.1624_1628delinsATTAC | |
2 | g.47466712_47466715del | CA16617582 | MSH2 | c.1565_1568del (p.Tyr522PhefsTer3) c.1367_1370del (p.Tyr456PhefsTer3) c.*105_*108del (n.*105_*108del) c.*331_*334del (n.*331_*334del) c.*537_*540del (n.*537_*540del) n.1637_1640del n.1627_1630del | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466713_47466765del | CA2586969204 | MSH2 | c.1566_1618del (p.Tyr522Ter) c.1368_1420del (p.Tyr456Ter) c.1566_*14del c.*106_*158del (n.*106_*158del) c.*332_*384del (n.*332_*384del) c.*538_*590del (n.*538_*590del) n.1638_1690del n.1628_1680del | |
2 | g.47466712A= | CA2495867289 | MSH2 | c.1565A= (p.Tyr522=) c.1367A= (p.Tyr456=) c.*105A= (n.*105A=) c.*331A= (n.*331A=) c.*537A= (n.*537A=) n.1637A= n.1627A= | |
2 | g.47466712A>C | CA346727816 | MSH2 | c.1565A>C (p.Tyr522Ser) c.1367A>C (p.Tyr456Ser) c.*105A>C (n.*105A>C) c.*331A>C (n.*331A>C) c.*537A>C (n.*537A>C) n.1637A>C n.1627A>C | dbSNP |
2 | g.47466712A>G | CA346727814 | MSH2 | c.1565A>G (p.Tyr522Cys) c.1367A>G (p.Tyr456Cys) c.*105A>G (n.*105A>G) c.*331A>G (n.*331A>G) c.*537A>G (n.*537A>G) n.1637A>G n.1627A>G | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466712A>T | CA346727815 | MSH2 | c.1565A>T (p.Tyr522Phe) c.1367A>T (p.Tyr456Phe) c.*105A>T (n.*105A>T) c.*331A>T (n.*331A>T) c.*537A>T (n.*537A>T) n.1637A>T n.1627A>T | dbSNP |
2 | g.47466713del | CA2582342367 | MSH2 | c.1566del (p.Arg524ValfsTer2) c.1368del (p.Arg458ValfsTer2) c.*106del (n.*106del) c.*332del (n.*332del) c.*538del (n.*538del) n.1638del n.1628del | ClinVar |
2 | g.47466713C>A | CA346727817 | MSH2 | c.1566C>A (p.Tyr522Ter) c.1368C>A (p.Tyr456Ter) c.*106C>A (n.*106C>A) c.*332C>A (n.*332C>A) c.*538C>A (n.*538C>A) n.1638C>A n.1628C>A | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466713C= | CA2495867291 | MSH2 | c.1566C= (p.Tyr522=) c.1368C= (p.Tyr456=) c.*106C= (n.*106C=) c.*332C= (n.*332C=) c.*538C= (n.*538C=) n.1638C= n.1628C= | |
2 | g.47466713C>G | CA018620 | MSH2 | c.1566C>G (p.Tyr522Ter) c.1368C>G (p.Tyr456Ter) c.*106C>G (n.*106C>G) c.*332C>G (n.*332C>G) c.*538C>G (n.*538C>G) n.1638C>G n.1628C>G | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466713C>T | CA425965591 | MSH2 | c.1566C>T (p.Tyr522=) c.1368C>T (p.Tyr456=) c.*106C>T (n.*106C>T) c.*332C>T (n.*332C>T) c.*538C>T (n.*538C>T) n.1638C>T n.1628C>T | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466713_47466714delinsCT | CA2495867290 | MSH2 | c.1566_1567delinsCT (p.Tyr522=) c.1368_1369delinsCT (p.Tyr456=) c.*106_*107delinsCT (n.*106_*107delinsCT) c.*332_*333delinsCT (n.*332_*333delinsCT) c.*538_*539delinsCT (n.*538_*539delinsCT) n.1638_1639delinsCT n.1628_1629delinsCT | |
2 | g.47466714T>A | CA018626 | MSH2 | c.1567T>A (p.Phe523Ile) c.1369T>A (p.Phe457Ile) c.*107T>A (n.*107T>A) c.*333T>A (n.*333T>A) c.*539T>A (n.*539T>A) n.1639T>A n.1629T>A | dbSNP |
2 | g.47466714T>C | CA346727818 | MSH2 | c.1567T>C (p.Phe523Leu) c.1369T>C (p.Phe457Leu) c.*107T>C (n.*107T>C) c.*333T>C (n.*333T>C) c.*539T>C (n.*539T>C) n.1639T>C n.1629T>C | |
2 | g.47466714T>G | CA346727819 | MSH2 | c.1567T>G (p.Phe523Val) c.1369T>G (p.Phe457Val) c.*107T>G (n.*107T>G) c.*333T>G (n.*333T>G) c.*539T>G (n.*539T>G) n.1639T>G n.1629T>G | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466714T= | CA2495867292 | MSH2 | c.1567T= (p.Phe523=) c.1369T= (p.Phe457=) c.*107T= (n.*107T=) c.*333T= (n.*333T=) c.*539T= (n.*539T=) n.1639T= n.1629T= | |
2 | g.47466716dup | CA2580066677 | MSH2 | c.1569dup (p.Arg524SerfsTer5) c.1371dup (p.Arg458SerfsTer5) c.*109dup (n.*109dup) c.*335dup (n.*335dup) c.*541dup (n.*541dup) n.1641dup n.1631dup | ClinVar |
2 | g.47466716del | CA46684987 | MSH2 | c.1569del (p.Arg524ValfsTer2) c.1371del (p.Arg458ValfsTer2) c.*109del (n.*109del) c.*335del (n.*335del) c.*541del (n.*541del) n.1641del n.1631del | ClinVar dbSNP COSMIC |
2 | g.47466715T>A | CA346727820 | MSH2 | c.1568T>A (p.Phe523Tyr) c.1370T>A (p.Phe457Tyr) c.*108T>A (n.*108T>A) c.*334T>A (n.*334T>A) c.*540T>A (n.*540T>A) n.1640T>A n.1630T>A | |
2 | g.47466715T>C | CA018632 | MSH2 | c.1568T>C (p.Phe523Ser) c.1370T>C (p.Phe457Ser) c.*108T>C (n.*108T>C) c.*334T>C (n.*334T>C) c.*540T>C (n.*540T>C) n.1640T>C n.1630T>C | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466715T>G | CA346727821 | MSH2 | c.1568T>G (p.Phe523Cys) c.1370T>G (p.Phe457Cys) c.*108T>G (n.*108T>G) c.*334T>G (n.*334T>G) c.*540T>G (n.*540T>G) n.1640T>G n.1630T>G | |
2 | g.47466715T= | CA2495867293 | MSH2 | c.1568T= (p.Phe523=) c.1370T= (p.Phe457=) c.*108T= (n.*108T=) c.*334T= (n.*334T=) c.*540T= (n.*540T=) n.1640T= n.1630T= | |
2 | g.47466715_47466717del | CA2739274366 | MSH2 | c.1568_1570del (p.Phe523_Arg524delinsCys) c.1370_1372del (p.Phe457_Arg458delinsCys) c.*108_*110del (n.*108_*110del) c.*334_*336del (n.*334_*336del) c.*540_*542del (n.*540_*542del) n.1640_1642del n.1630_1632del | ClinVar |
2 | g.47466716T>A | CA346727822 | MSH2 | c.1569T>A (p.Phe523Leu) c.1371T>A (p.Phe457Leu) c.*109T>A (n.*109T>A) c.*335T>A (n.*335T>A) c.*541T>A (n.*541T>A) n.1641T>A n.1631T>A | |
2 | g.47466716T>C | CA425965592 | MSH2 | c.1569T>C (p.Phe523=) c.1371T>C (p.Phe457=) c.*109T>C (n.*109T>C) c.*335T>C (n.*335T>C) c.*541T>C (n.*541T>C) n.1641T>C n.1631T>C | dbSNP |
2 | g.47466716T>G | CA346727823 | MSH2 | c.1569T>G (p.Phe523Leu) c.1371T>G (p.Phe457Leu) c.*109T>G (n.*109T>G) c.*335T>G (n.*335T>G) c.*541T>G (n.*541T>G) n.1641T>G n.1631T>G | |
2 | g.47466716_47466717delinsTC | CA2495867294 | MSH2 | c.1569_1570delinsTC (p.Phe523=) c.1371_1372delinsTC (p.Phe457=) c.*109_*110delinsTC (n.*109_*110delinsTC) c.*335_*336delinsTC (n.*335_*336delinsTC) c.*541_*542delinsTC (n.*541_*542delinsTC) n.1641_1642delinsTC n.1631_1632delinsTC | |
2 | g.47466717del | CA16617583 | MSH2 | c.1570del (p.Arg524ValfsTer2) c.1372del (p.Arg458ValfsTer2) c.*110del (n.*110del) c.*336del (n.*336del) c.*542del (n.*542del) n.1642del n.1632del | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466717C>A | CA346727824 | MSH2 | c.1570C>A (p.Arg524Ser) c.1372C>A (p.Arg458Ser) c.*110C>A (n.*110C>A) c.*336C>A (n.*336C>A) c.*542C>A (n.*542C>A) n.1642C>A n.1632C>A | dbSNP |
2 | g.47466717C= | CA2495867295 | MSH2 | c.1570C= (p.Arg524=) c.1372C= (p.Arg458=) c.*110C= (n.*110C=) c.*336C= (n.*336C=) c.*542C= (n.*542C=) n.1642C= n.1632C= | |
2 | g.47466717C>G | CA346727825 | MSH2 | c.1570C>G (p.Arg524Gly) c.1372C>G (p.Arg458Gly) c.*110C>G (n.*110C>G) c.*336C>G (n.*336C>G) c.*542C>G (n.*542C>G) n.1642C>G n.1632C>G | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466717C>T | CA029597 | MSH2 | c.1570C>T (p.Arg524Cys) c.1372C>T (p.Arg458Cys) c.*110C>T (n.*110C>T) c.*336C>T (n.*336C>T) c.*542C>T (n.*542C>T) n.1642C>T n.1632C>T | ClinVar dbSNP ExAC gnomAD v2 gnomAD v3 gnomAD v4 |
2 | g.47466718del | CA1139768715 | MSH2 | c.1571del (p.Arg524LeufsTer2) c.1373del (p.Arg458LeufsTer2) c.*111del (n.*111del) c.*337del (n.*337del) c.*543del (n.*543del) n.1643del n.1633del | |
2 | g.47466718G>A | CA018637 | MSH2 | c.1571G>A (p.Arg524His) c.1373G>A (p.Arg458His) c.*111G>A (n.*111G>A) c.*337G>A (n.*337G>A) c.*543G>A (n.*543G>A) n.1643G>A n.1633G>A | ClinVar dbSNP gnomAD v2 gnomAD v3 gnomAD v4 |
2 | g.47466718G>C | CA018643 | MSH2 | c.1571G>C (p.Arg524Pro) c.1373G>C (p.Arg458Pro) c.*111G>C (n.*111G>C) c.*337G>C (n.*337G>C) c.*543G>C (n.*543G>C) n.1643G>C n.1633G>C | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466718G= | CA2495867296 | MSH2 | c.1571G= (p.Arg524=) c.1373G= (p.Arg458=) c.*111G= (n.*111G=) c.*337G= (n.*337G=) c.*543G= (n.*543G=) n.1643G= n.1633G= | |
2 | g.47466718G>T | CA018649 | MSH2 | c.1571G>T (p.Arg524Leu) c.1373G>T (p.Arg458Leu) c.*111G>T (n.*111G>T) c.*337G>T (n.*337G>T) c.*543G>T (n.*543G>T) n.1643G>T n.1633G>T | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466718_47466737dup | CA1139655572 | MSH2 | c.1571_1590dup (p.Lys531ValfsTer2) c.1373_1392dup (p.Lys465ValfsTer2) c.1571_1588dup c.*111_*130dup (n.*111_*130dup) c.*337_*356dup (n.*337_*356dup) c.*543_*562dup (n.*543_*562dup) n.1643_1662dup n.1633_1652dup | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466719del | CA2580066682 | MSH2 | c.1572del (p.Val525Ter) c.1374del (p.Val459Ter) c.*112del (n.*112del) c.*338del (n.*338del) c.*544del (n.*544del) n.1644del n.1634del | ClinVar |
2 | g.47466719T>A | CA425965593 | MSH2 | c.1572T>A (p.Arg524=) c.1374T>A (p.Arg458=) c.*112T>A (n.*112T>A) c.*338T>A (n.*338T>A) c.*544T>A (n.*544T>A) n.1644T>A n.1634T>A | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466719T>C | CA425965594 | MSH2 | c.1572T>C (p.Arg524=) c.1374T>C (p.Arg458=) c.*112T>C (n.*112T>C) c.*338T>C (n.*338T>C) c.*544T>C (n.*544T>C) n.1644T>C n.1634T>C | dbSNP |
2 | g.47466719T>G | CA425965595 | MSH2 | c.1572T>G (p.Arg524=) c.1374T>G (p.Arg458=) c.*112T>G (n.*112T>G) c.*338T>G (n.*338T>G) c.*544T>G (n.*544T>G) n.1644T>G n.1634T>G | |
2 | g.47466720G>A | CA346727826 | MSH2 | c.1573G>A (p.Val525Ile) c.1375G>A (p.Val459Ile) c.*113G>A (n.*113G>A) c.*339G>A (n.*339G>A) c.*545G>A (n.*545G>A) n.1645G>A n.1635G>A | ClinVar dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
2 | g.47466720G>C | CA346727827 | MSH2 | c.1573G>C (p.Val525Leu) c.1375G>C (p.Val459Leu) c.*113G>C (n.*113G>C) c.*339G>C (n.*339G>C) c.*545G>C (n.*545G>C) n.1645G>C n.1635G>C | dbSNP |
2 | g.47466720G= | CA2495867297 | MSH2 | c.1573G= (p.Val525=) c.1375G= (p.Val459=) c.*113G= (n.*113G=) c.*339G= (n.*339G=) c.*545G= (n.*545G=) n.1645G= n.1635G= | |
2 | g.47466720G>T | CA346727828 | MSH2 | c.1573G>T (p.Val525Leu) c.1375G>T (p.Val459Leu) c.*113G>T (n.*113G>T) c.*339G>T (n.*339G>T) c.*545G>T (n.*545G>T) n.1645G>T n.1635G>T | ClinVar |
2 | g.47466721T>A | CA346727829 | MSH2 | c.1574T>A (p.Val525Glu) c.1376T>A (p.Val459Glu) c.*114T>A (n.*114T>A) c.*340T>A (n.*340T>A) c.*546T>A (n.*546T>A) n.1646T>A n.1636T>A | |
2 | g.47466721T>C | CA346727831 | MSH2 | c.1574T>C (p.Val525Ala) c.1376T>C (p.Val459Ala) c.*114T>C (n.*114T>C) c.*340T>C (n.*340T>C) c.*546T>C (n.*546T>C) n.1646T>C n.1636T>C |