Chr | Mutation (hg38) | CAid | Gene | Transcript | Linkouts |
---|---|---|---|---|---|
2 | g.47466676_47466684del | CA2586969197 | MSH2 | c.1529_1537del (p.Gln510_Lys512del) c.1331_1339del (p.Gln444_Lys446del) c.*69_*77del (n.*69_*77del) c.*295_*303del (n.*295_*303del) c.*501_*509del (n.*501_*509del) n.1601_1609del n.1591_1599del | |
2 | g.47466676_47466686delinsAGATTAAACTG | CA2495867257 | MSH2 | c.1529_1539delinsAGATTAAACTG (p.Gln510=) c.1331_1341delinsAGATTAAACTG (p.Gln444=) c.*69_*79delinsAGATTAAACTG (n.*69_*79delinsAGATTAAACTG) c.*295_*305delinsAGATTAAACTG (n.*295_*305delinsAGATTAAACTG) c.*501_*511delinsAGATTAAACTG (n.*501_*511delinsAGATTAAACTG) n.1601_1611delinsAGATTAAACTG n.1591_1601delinsAGATTAAACTG | |
2 | g.47466681_47466690del | CA645372539 | MSH2 | c.1534_1543del (p.Lys512ProfsTer11) c.1336_1345del (p.Lys446ProfsTer11) c.*74_*83del (n.*74_*83del) c.*300_*309del (n.*300_*309del) c.*506_*515del (n.*506_*515del) n.1606_1615del n.1596_1605del | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466679_47466685del | CA2580066918 | MSH2 | c.1532_1538del (p.Ile511ArgfsTer13) c.1334_1340del (p.Ile445ArgfsTer13) c.*72_*78del (n.*72_*78del) c.*298_*304del (n.*298_*304del) c.*504_*510del (n.*504_*510del) n.1604_1610del n.1594_1600del | ClinVar |
2 | g.47466684C>A | CA346727757 | MSH2 | c.1537C>A (p.Leu513Met) c.1339C>A (p.Leu447Met) c.*77C>A (n.*77C>A) c.*303C>A (n.*303C>A) c.*509C>A (n.*509C>A) n.1609C>A n.1599C>A | |
2 | g.47466684C= | CA2495867265 | MSH2 | c.1537C= (p.Leu513=) c.1339C= (p.Leu447=) c.*77C= (n.*77C=) c.*303C= (n.*303C=) c.*509C= (n.*509C=) n.1609C= n.1599C= | |
2 | g.47466684C>G | CA346727758 | MSH2 | c.1537C>G (p.Leu513Val) c.1339C>G (p.Leu447Val) c.*77C>G (n.*77C>G) c.*303C>G (n.*303C>G) c.*509C>G (n.*509C>G) n.1609C>G n.1599C>G | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466684C>T | CA425965576 | MSH2 | c.1537C>T (p.Leu513=) c.1339C>T (p.Leu447=) c.*77C>T (n.*77C>T) c.*303C>T (n.*303C>T) c.*509C>T (n.*509C>T) n.1609C>T n.1599C>T | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466684_47466686delinsCTG | CA2495867264 | MSH2 | c.1537_1539delinsCTG (p.Leu513=) c.1339_1341delinsCTG (p.Leu447=) c.*77_*79delinsCTG (n.*77_*79delinsCTG) c.*303_*305delinsCTG (n.*303_*305delinsCTG) c.*509_*511delinsCTG (n.*509_*511delinsCTG) n.1609_1611delinsCTG n.1599_1601delinsCTG | |
2 | g.47466685T>A | CA346727759 | MSH2 | c.1538T>A (p.Leu513Gln) c.1340T>A (p.Leu447Gln) c.*78T>A (n.*78T>A) c.*304T>A (n.*304T>A) c.*510T>A (n.*510T>A) n.1610T>A n.1600T>A | |
2 | g.47466685T>C | CA346727760 | MSH2 | c.1538T>C (p.Leu513Pro) c.1340T>C (p.Leu447Pro) c.*78T>C (n.*78T>C) c.*304T>C (n.*304T>C) c.*510T>C (n.*510T>C) n.1610T>C n.1600T>C | gnomAD v4 |
2 | g.47466685T>G | CA346727761 | MSH2 | c.1538T>G (p.Leu513Arg) c.1340T>G (p.Leu447Arg) c.*78T>G (n.*78T>G) c.*304T>G (n.*304T>G) c.*510T>G (n.*510T>G) n.1610T>G n.1600T>G | |
2 | g.47466685_47466686del | CA279678 | MSH2 | c.1538_1539del (p.Leu513ArgfsTer15) c.1340_1341del (p.Leu447ArgfsTer15) c.*78_*79del (n.*78_*79del) c.*304_*305del (n.*304_*305del) c.*510_*511del (n.*510_*511del) n.1610_1611del n.1600_1601del | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466690_47466708del | CA2499216045 | MSH2 | c.1543_1561del (p.Ser515IlefsTer5) c.1345_1363del (p.Ser449IlefsTer5) c.*83_*101del (n.*83_*101del) c.*309_*327del (n.*309_*327del) c.*515_*533del (n.*515_*533del) n.1615_1633del n.1605_1623del | ClinVar dbSNP |
2 | g.47466686G>A | CA029432 | MSH2 | c.1539G>A (p.Leu513=) c.1341G>A (p.Leu447=) c.*79G>A (n.*79G>A) c.*305G>A (n.*305G>A) c.*511G>A (n.*511G>A) n.1611G>A n.1601G>A | ClinVar dbSNP ExAC gnomAD v2 gnomAD v4 |
2 | g.47466686G>C | CA425965577 | MSH2 | c.1539G>C (p.Leu513=) c.1341G>C (p.Leu447=) c.*79G>C (n.*79G>C) c.*305G>C (n.*305G>C) c.*511G>C (n.*511G>C) n.1611G>C n.1601G>C | dbSNP |
2 | g.47466686G= | CA2495867266 | MSH2 | c.1539G= (p.Leu513=) c.1341G= (p.Leu447=) c.*79G= (n.*79G=) c.*305G= (n.*305G=) c.*511G= (n.*511G=) n.1611G= n.1601G= | |
2 | g.47466686G>T | CA425965578 | MSH2 | c.1539G>T (p.Leu513=) c.1341G>T (p.Leu447=) c.*79G>T (n.*79G>T) c.*305G>T (n.*305G>T) c.*511G>T (n.*511G>T) n.1611G>T n.1601G>T | dbSNP |
2 | g.47466687G>A | CA346727762 | MSH2 | c.1540G>A (p.Asp514Asn) c.1342G>A (p.Asp448Asn) c.*80G>A (n.*80G>A) c.*306G>A (n.*306G>A) c.*512G>A (n.*512G>A) n.1612G>A n.1602G>A | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466687G>C | CA346727763 | MSH2 | c.1540G>C (p.Asp514His) c.1342G>C (p.Asp448His) c.*80G>C (n.*80G>C) c.*306G>C (n.*306G>C) c.*512G>C (n.*512G>C) n.1612G>C n.1602G>C | dbSNP |
2 | g.47466687G>T | CA346727764 | MSH2 | c.1540G>T (p.Asp514Tyr) c.1342G>T (p.Asp448Tyr) c.*80G>T (n.*80G>T) c.*306G>T (n.*306G>T) c.*512G>T (n.*512G>T) n.1612G>T n.1602G>T | dbSNP |
2 | g.47466688A>C | CA346727765 | MSH2 | c.1541A>C (p.Asp514Ala) c.1343A>C (p.Asp448Ala) c.*81A>C (n.*81A>C) c.*307A>C (n.*307A>C) c.*513A>C (n.*513A>C) n.1613A>C n.1603A>C | dbSNP |
2 | g.47466688A>G | CA346727766 | MSH2 | c.1541A>G (p.Asp514Gly) c.1343A>G (p.Asp448Gly) c.*81A>G (n.*81A>G) c.*307A>G (n.*307A>G) c.*513A>G (n.*513A>G) n.1613A>G n.1603A>G | |
2 | g.47466688A>T | CA346727767 | MSH2 | c.1541A>T (p.Asp514Val) c.1343A>T (p.Asp448Val) c.*81A>T (n.*81A>T) c.*307A>T (n.*307A>T) c.*513A>T (n.*513A>T) n.1613A>T n.1603A>T | dbSNP |
2 | g.47466689T>A | CA346727768 | MSH2 | c.1542T>A (p.Asp514Glu) c.1344T>A (p.Asp448Glu) c.*82T>A (n.*82T>A) c.*308T>A (n.*308T>A) c.*514T>A (n.*514T>A) n.1614T>A n.1604T>A | dbSNP |
2 | g.47466689T>C | CA425965579 | MSH2 | c.1542T>C (p.Asp514=) c.1344T>C (p.Asp448=) c.*82T>C (n.*82T>C) c.*308T>C (n.*308T>C) c.*514T>C (n.*514T>C) n.1614T>C n.1604T>C | COSMIC |
2 | g.47466689T>G | CA346727769 | MSH2 | c.1542T>G (p.Asp514Glu) c.1344T>G (p.Asp448Glu) c.*82T>G (n.*82T>G) c.*308T>G (n.*308T>G) c.*514T>G (n.*514T>G) n.1614T>G n.1604T>G | |
2 | g.47466690del | CA2580066949 | MSH2 | c.1543del (p.Ser515ProfsTer11) c.1345del (p.Ser449ProfsTer11) c.*83del (n.*83del) c.*309del (n.*309del) c.*515del (n.*515del) n.1615del n.1605del | ClinVar |
2 | g.47466690T>A | CA346727772 | MSH2 | c.1543T>A (p.Ser515Thr) c.1345T>A (p.Ser449Thr) c.*83T>A (n.*83T>A) c.*309T>A (n.*309T>A) c.*515T>A (n.*515T>A) n.1615T>A n.1605T>A | |
2 | g.47466690T>C | CA346727771 | MSH2 | c.1543T>C (p.Ser515Pro) c.1345T>C (p.Ser449Pro) c.*83T>C (n.*83T>C) c.*309T>C (n.*309T>C) c.*515T>C (n.*515T>C) n.1615T>C n.1605T>C | |
2 | g.47466690T>G | CA346727770 | MSH2 | c.1543T>G (p.Ser515Ala) c.1345T>G (p.Ser449Ala) c.*83T>G (n.*83T>G) c.*309T>G (n.*309T>G) c.*515T>G (n.*515T>G) n.1615T>G n.1605T>G | |
2 | g.47466691C>A | CA346727773 | MSH2 | c.1544C>A (p.Ser515Tyr) c.1346C>A (p.Ser449Tyr) c.*84C>A (n.*84C>A) c.*310C>A (n.*310C>A) c.*516C>A (n.*516C>A) n.1616C>A n.1606C>A | ClinVar gnomAD v4 |
2 | g.47466691C= | CA2495867267 | MSH2 | c.1544C= (p.Ser515=) c.1346C= (p.Ser449=) c.*84C= (n.*84C=) c.*310C= (n.*310C=) c.*516C= (n.*516C=) n.1616C= n.1606C= | |
2 | g.47466691C>G | CA346727774 | MSH2 | c.1544C>G (p.Ser515Cys) c.1346C>G (p.Ser449Cys) c.*84C>G (n.*84C>G) c.*310C>G (n.*310C>G) c.*516C>G (n.*516C>G) n.1616C>G n.1606C>G | ClinVar dbSNP gnomAD v2 gnomAD v4 |
2 | g.47466691C>T | CA346727775 | MSH2 | c.1544C>T (p.Ser515Phe) c.1346C>T (p.Ser449Phe) c.*84C>T (n.*84C>T) c.*310C>T (n.*310C>T) c.*516C>T (n.*516C>T) n.1616C>T n.1606C>T | |
2 | g.47466692C>A | CA425965582 | MSH2 | c.1545C>A (p.Ser515=) c.1347C>A (p.Ser449=) c.*85C>A (n.*85C>A) c.*311C>A (n.*311C>A) c.*517C>A (n.*517C>A) n.1617C>A n.1607C>A | |
2 | g.47466692C= | CA2495867268 | MSH2 | c.1545C= (p.Ser515=) c.1347C= (p.Ser449=) c.*85C= (n.*85C=) c.*311C= (n.*311C=) c.*517C= (n.*517C=) n.1617C= n.1607C= | |
2 | g.47466692C>G | CA425965581 | MSH2 | c.1545C>G (p.Ser515=) c.1347C>G (p.Ser449=) c.*85C>G (n.*85C>G) c.*311C>G (n.*311C>G) c.*517C>G (n.*517C>G) n.1617C>G n.1607C>G | dbSNP |
2 | g.47466692C>T | CA425965580 | MSH2 | c.1545C>T (p.Ser515=) c.1347C>T (p.Ser449=) c.*85C>T (n.*85C>T) c.*311C>T (n.*311C>T) c.*517C>T (n.*517C>T) n.1617C>T n.1607C>T | ClinVar dbSNP gnomAD v4 |
2 | g.47466693A= | CA2495867269 | MSH2 | c.1546A= (p.Ser516=) c.1348A= (p.Ser450=) c.*86A= (n.*86A=) c.*312A= (n.*312A=) c.*518A= (n.*518A=) n.1618A= n.1608A= | |
2 | g.47466693A>C | CA346727776 | MSH2 | c.1546A>C (p.Ser516Arg) c.1348A>C (p.Ser450Arg) c.*86A>C (n.*86A>C) c.*312A>C (n.*312A>C) c.*518A>C (n.*518A>C) n.1618A>C n.1608A>C | dbSNP |
2 | g.47466693A>G | CA10582015 | MSH2 | c.1546A>G (p.Ser516Gly) c.1348A>G (p.Ser450Gly) c.*86A>G (n.*86A>G) c.*312A>G (n.*312A>G) c.*518A>G (n.*518A>G) n.1618A>G n.1608A>G | ClinVar dbSNP gnomAD v2 gnomAD v4 |
2 | g.47466693A>T | CA346727777 | MSH2 | c.1546A>T (p.Ser516Cys) c.1348A>T (p.Ser450Cys) c.*86A>T (n.*86A>T) c.*312A>T (n.*312A>T) c.*518A>T (n.*518A>T) n.1618A>T n.1608A>T | dbSNP |
2 | g.47466694del | CA2586969202 | MSH2 | c.1547del (p.Ser516MetfsTer10) c.1349del (p.Ser450MetfsTer10) c.*87del (n.*87del) c.*313del (n.*313del) c.*519del (n.*519del) n.1619del n.1609del | |
2 | g.47466694G>A | CA338107 | MSH2 | c.1547G>A (p.Ser516Asn) c.1349G>A (p.Ser450Asn) c.*87G>A (n.*87G>A) c.*313G>A (n.*313G>A) c.*519G>A (n.*519G>A) n.1619G>A n.1609G>A | ClinVar dbSNP gnomAD v3 gnomAD v4 |
2 | g.47466694G>C | CA029448 | MSH2 | c.1547G>C (p.Ser516Thr) c.1349G>C (p.Ser450Thr) c.*87G>C (n.*87G>C) c.*313G>C (n.*313G>C) c.*519G>C (n.*519G>C) n.1619G>C n.1609G>C | dbSNP ExAC gnomAD v2 gnomAD v3 gnomAD v4 |
2 | g.47466694G= | CA2495867270 | MSH2 | c.1547G= (p.Ser516=) c.1349G= (p.Ser450=) c.*87G= (n.*87G=) c.*313G= (n.*313G=) c.*519G= (n.*519G=) n.1619G= n.1609G= | |
2 | g.47466694G>T | CA018578 | MSH2 | c.1547G>T (p.Ser516Ile) c.1349G>T (p.Ser450Ile) c.*87G>T (n.*87G>T) c.*313G>T (n.*313G>T) c.*519G>T (n.*519G>T) n.1619G>T n.1609G>T | ClinVar dbSNP ExAC gnomAD v3 gnomAD v4 |
2 | g.47466694_47466695delinsGT | CA2495867271 | MSH2 | c.1547_1548delinsGT (p.Ser516=) c.1349_1350delinsGT (p.Ser450=) c.*87_*88delinsGT (n.*87_*88delinsGT) c.*313_*314delinsGT (n.*313_*314delinsGT) c.*519_*520delinsGT (n.*519_*520delinsGT) n.1619_1620delinsGT n.1609_1610delinsGT | |
2 | g.47466695del | CA1139655566 | MSH2 | c.1548del (p.Ser516ArgfsTer10) c.1350del (p.Ser450ArgfsTer10) c.*88del (n.*88del) c.*314del (n.*314del) c.*520del (n.*520del) n.1620del n.1610del | ClinVar dbSNP |